造成男女发病率差异的原因是很复杂的。如外伤和意外以男性为多，恐怕主要是男性从事危险性工作或参加容易造成伤害的机会较高的结果，性别的生理差异并非其主因。

  有些疾病的性别差异，则可以用生理差别来解释。例如色盲，患者分不清红和绿，或者不能区分某种颜色。这类缺陷并非罕见，在一般人群中，每100名男性中有1名，而100名女性中仅0.8名。这是一种遗传性遗传，其传递方式在医学遗传学上称为X伴性隐性遗传。前面已说过，X是一条性染色体，男女均有。在X染色体上，不仅有决定性分化的基因，还有一些基因是控制人体其他性状的。导致色盲的基因都位于X染色体上。但是，这类色盲基因属于隐性基因。如果，一名女性的另外一条X染色体中和它位点相同的等位基因是正常的，色盲便不显示出来。她只是色盲基因携带者，而不是色盲患者。只有当另一X染色体也带色盲基因，才成为色盲者。然而，男性的性染色体是XY，只有一条X染色体，只要在这条X染色体上存在色盲基因，便是色盲。所以，男性色盲患者便自然要比女性多得多。

  有些疾病的性别分布的区别，可以用男女的内分泌不同来解释。例如十二指肠溃疡多见于男性。育龄期妇女即使患有十二指肠溃疡，她们的症状也比男性轻得多，较少发生出血，穿孔或幽门梗阻等并发症。妊娠妇女，更是极少患有活动性溃疡的。这些事实，使人们联想到可能雌激素对十二指肠粘膜有保护作用，因此有人试用雌激素治疗溃疡病，结果取得一定疗效，只是效果不如其他更有针对性的药物，如西米替丁和胃舒平之类。但是，这一试验至少证明了雌激素对十二指肠溃疡有非特异的作用。

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